肛门疼痛凸起小疙瘩可能是痔疮、肛裂、直肠息肉导致的。

痔疮是由于长期便秘或腹泻等原因引起的肛门静脉曲张所致；肛裂则是由于肛管皮肤因排便过硬而撕裂，形成溃疡面，久之则上端皮赘形成；直肠息肉是指从肠道黏膜表面突出到肠腔内的隆起性病变，当体积增大至一定程度时，可能会对周围组织产生压迫和刺激，从而引起疼痛和肿块。以上这些疾病均可能导致肛门疼痛和凸出的小疙瘩，需要及时就医以便明确诊断和治疗。

此外，还应考虑是否存在肛周脓肿、肛瘘等感染性疾病以及恶性肿瘤的可能性。针对这种情况，建议患者定期进行肛门检查以早期发现异常。

在日常生活中，患者应注意保持肛门清洁干燥，避免长时间坐立不动，同时调整饮食习惯，避免辛辣刺激食物，以减少症状发生的风险。