大拇指甲盖凹陷可能是由维生素A缺乏、缺铁性贫血、银屑病、甲癣、遗传因素等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.维生素A缺乏

维生素A缺乏导致角质化异常和指甲生长不规则。通过口服维生素A补充剂进行治疗。

2.缺铁性贫血

缺铁性贫血引起血红蛋白合成不足，影响指甲生长环境，从而出现指甲凹陷的情况。可通过服用硫酸亚铁片、富马酸亚铁片等药物补铁治疗。

3.银屑病

银屑病是一种免疫介导的炎症性疾病，会导致皮肤细胞过度增生，包括指甲母细胞。指甲母细胞受到炎症的影响而受损，可能导致指甲凹陷。患者可遵医嘱使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等药物局部涂抹。

4.甲癣

甲癣由真菌感染引起，真菌侵犯指甲组织，破坏指甲结构，导致指甲变薄、变形和凹陷。抗真菌药如特比萘芬、伊曲康唑可用于治疗甲癣。

5.遗传因素

部分指甲凹陷可能与遗传有关，家族中存在类似特征的人更易受影响。针对遗传因素引起的指甲凹陷通常无法预防，但保持健康的生活习惯有助于减少不适发生概率。

建议定期进行血液学检查以评估铁储备状态；若为遗传因素所致，则应关注并监测相关疾病的进展，必要时进行基因检测。