阴茎短小可能与肾有一定关系，但多数情况下是由于遗传因素、外伤因素导致。如果存在性功能障碍或不育的情况，则考虑与慢性前列腺炎、精索静脉曲张等疾病有关。

一、与肾有关系

中医认为肾脏藏精，主生长发育，因此若患者先天肾气不足时，可影响到阴茎的发育，从而出现阴茎较小的情况。此时可在医生指导下使用金匮肾气丸、右归丸等药物进行治疗，以达到补肾的作用。此外，还可通过针灸的方式辅助治疗，常用的穴位包括关元穴、命门穴、三阴交穴、照海穴等。

二、没有关系

1.遗传：阴茎大小主要由基因决定，父母身材矮小也可引起子代阴茎偏小，这种情况通常不需要特殊处理。

2.外伤：如青少年期在运动时不慎损伤阴茎，导致阴茎血供受损，就可能会导致阴茎发育不良，而表现为阴茎较短小的症状。一般需要及时就医，在医生操作下进行修复手术来改善症状。

3.慢性前列腺炎：多见于久坐、酗酒的人群，也可能是细菌感染所致，炎症刺激会导致阴囊肿胀、疼痛，并且还会对生殖器官造成影响，使阴茎海绵体体积缩小，甚至会影响阴茎勃起，还可能出现排尿异常以及会阴部不适等症状。可以遵医嘱服用头孢克肟分散片、阿奇霉素胶囊等药物治疗。

4.精索静脉曲张：通常是静脉瓣膜功能不全或者是血液回流障碍所引起，可导致阴囊坠胀，并伴有疼痛感和坠痛感，还有可能导致男性不育。需遵医嘱应用迈之灵片、地奥司明片等药物治疗，必要时可通过腹腔镜下精索静脉高位结扎术进行治疗。

除此之外，若存在睾丸肿瘤等情况，也会引起上述情况。建议阴茎短小者前往医院男科就诊，完善视诊、激素水平测定等检查后明确病因并积极治疗。