扁桃体长期肿大疼痛可能是由多种病因导致的，其中也包括了恶性肿瘤，如扁桃体癌。

扁桃体癌是一种罕见的头颈部恶性肿瘤，其病因尚未完全明确，可能与吸烟、饮酒、人乳头瘤病毒感染等因素有关。该病通常表现为扁桃体区域的持续性肿块、疼痛、出血等症状，如果不及时治疗，可能会扩散到周围淋巴结和其他器官，严重时甚至会危及生命。因此，对于存在上述症状的患者，应及时就医进行相关检查，以便早期发现和治疗。

扁桃体长期肿大且伴有疼痛还应考虑慢性咽炎、急性化脓性扁桃体炎等疾病。这些疾病都可能导致扁桃体反复炎症反应，从而出现长期肿大的现象，并伴随疼痛感。

针对扁桃体长期肿大疼痛的情况，建议患者定期观察扁桃体的变化，同时还要注意口腔卫生，避免接触过敏原，以免加重病情。