扁桃体上有小孔不一定是癌症，也可能是先天发育异常、慢性扁桃体炎等原因引起的。

扁桃体位于口腔后部两侧，其主要作用是免疫防御，当受到病原体入侵时，可能会发生炎症反应，甚至形成脓肿，从而导致扁桃体表面出现小孔。而癌症则是一种起源于上皮细胞的恶性肿瘤，通常表现为新生物生长迅速且难以治愈。因此，若患者发现扁桃体有小孔，应及时就医进行专业评估和治疗。

除了癌症外，还有异物滞留、局部增生等疾病可能导致扁桃体上面出现洞状结构。这些疾病都可能引发局部组织损伤或炎症反应，需要进一步检查以确定具体原因。

在诊断扁桃体上的洞是否为癌症时，应考虑多种可能性，并排除其他潜在病因。建议定期观察病情变化，必要时进行活检等进一步检查，以便及时发现并处理任何异常情况。