直肠保肛手术后肛门疼痛可能由术后切口愈合不良、感染、排便困难、复发转移等原因引起。

术后切口愈合不良会导致持续性的疼痛，而感染则会引起局部红肿、热痛等炎症表现。排便困难可能会加重肛门疼痛，因为增加肛门周围肌肉及韧带的压力。复发转移是指癌症细胞从原处扩散到其他部位，如果转移到肛门附近，也可能会引发疼痛。

患者在术后还应注意保持大便通畅，避免便秘或腹泻，以免影响伤口愈合。

术后患者应定期复查，以便及时发现并处理任何可能出现的问题。同时还要注意观察是否有出血、发热等症状，并遵循医嘱进行药物治疗以减轻不适症状。