直肠囊肿伴发发烧和疼痛可以考虑抗生素治疗、镇痛药物、中药外敷、针灸疗法、直肠切除术等方法来缓解症状。如果症状持续或加重，应尽快就医以获得专业评估和治疗。

1.抗生素治疗

抗生素通过抑制细菌生长或杀死病原体来控制感染，例如使用青霉素、头孢菌素等。在细菌性感染引起的直肠囊肿伴随发热和疼痛时使用。

2.镇痛药物

镇痛药物可以缓解由直肠囊肿引起的疼痛症状，如服用阿司匹林、布洛芬缓释胶囊等非甾体抗炎药。当患者因囊肿压迫神经而感到剧烈腹痛时可考虑使用。

3.中药外敷

中医认为囊肿是体内湿邪积聚所致，外敷具有消肿止痛的作用，如使用黄柏、栀子研磨成粉后加醋调制外敷于患处。对于表浅且大小固定的直肠囊肿伴有轻微不适时可尝试。

4.针灸疗法

针灸能够调节气血流通，缓解局部肌肉紧张和疼痛，常选用穴位有足三里、曲池穴等。对于存在轻度疼痛及功能障碍者有一定的效果。

5.直肠切除术

直肠切除术是一种外科手术，旨在移除异常组织，包括囊肿，以减轻压力和疼痛。如果保守治疗无效或囊肿恶变，则需要考虑手术治疗。

在诊断为直肠囊肿并发感染的情况下，应立即就医以便获得适当的抗生素治疗。同时，注意休息，避免食用辛辣刺激性食物，以免加重炎症反应。