疱疹性咽峡炎是由柯萨奇病毒引起的急性上呼吸道感染，而咽喉炎是多种因素导致的咽部、喉部黏膜炎症。

疱疹性咽峡炎由柯萨奇病毒感染引起，主要通过飞沫传播。该病毒侵入人体后，在局部复制并释放毒素，刺激机体产生免疫应答，引发炎症反应。咽喉炎通常由细菌或真菌感染引起，也可能因过敏、烟酒刺激等因素诱发，这些因素会导致咽喉部位的黏膜出现充血、水肿等现象。疱疹性咽峡炎的症状包括咽痛、发热、头痛以及呕吐等。咽喉炎的主要症状为喉咙疼痛、声音嘶哑、吞咽困难等。

针对这两种疾病的诊断可以通过咽拭子培养法检测柯萨奇病毒核酸以确认疱疹性咽峡炎。对于咽喉炎，则可使用间接喉镜或纤维喉镜观察咽喉内部情况。两种疾病的治疗方式略有不同。疱疹性咽峡炎通常采用抗病毒药物如利巴韦林颗粒进行治疗，疗程一般为5天左右。咽喉炎则需依据致病原因选用抗生素或抗真菌药，如阿莫西林克拉维酸钾片、氟康唑胶囊等。

患者平时应注意休息，避免辛辣食物，保持充足的水分摄入，有助于促进病情恢复。