肛窦炎经过治疗后有可能会复发。因为肛窦位于直肠内壁，在大便通过的过程中会有开口与肛管内部，容易受到细菌感染而发生炎症反应。

如果在日常生活中不注意饮食健康或者生活习惯不佳，则可能会增加肛窦炎复发的风险。此外，患有其他消化系统疾病、免疫力低下等因素也可能导致病情反复发作。

对于轻度的肛窦炎患者，可以通过改变生活方式和饮食习惯来缓解症状，例如避免便秘、坐浴等。同时也可以遵医嘱使用一些抗菌药物进行治疗，如阿莫西林胶囊、头孢克肟片等。而对于重度的肛窦炎患者，则可能需要接受手术治疗，以清除病灶并预防复发。

总之，虽然肛窦炎有复发的可能性，但采取适当的治疗方法并保持良好的卫生习惯可以减少其发生的概率。建议及时就医，并遵循医生的指导进行规范化的治疗和管理。