做完精囊镜后小便刺痛可能是由于术后尿道损伤引起的。

精囊镜是一种微创手术，通过将一根细长的内窥镜插入尿道，经由前列腺进入精囊，进行检查或治疗。在手术过程中，需要扩张尿道和精囊，这会导致尿道黏膜受到刺激和损伤，引起小便刺痛的症状。这种疼痛一般会在数日内自行缓解，但如果伴随有血尿、发热等其他症状，则应及时就医。

患者还可能出现排尿困难、尿频、尿急等症状，可能与术后局部组织水肿压迫尿道有关。

术后应遵循医嘱，多饮水，促进排尿，以减轻尿道刺激；同时避免辛辣食物摄入，以免加重尿道不适。