清宫后第二个月出现小腹痛和腰酸可能是由术后感染引起的。

清宫术是一种侵入性操作，会破坏子宫内膜完整性，增加细菌入侵的风险。若术后个人卫生不佳或过早进行性生活，则可能会诱发感染，导致子宫内膜炎或盆腔炎，进而引起上述不适症状。

此外，还应考虑是否有肠痉挛、泌尿系统结石等非妇科疾病原因导致的小腹痛和腰酸。因为这些疾病也可能引发类似的症状，但与清宫术无关。

建议患者及时就医，完善相关检查以确定具体原因，并接受相应治疗。日常生活中注意休息，避免过度劳累，同时保持局部清洁干燥，预防感染的发生。