口腔感染衣原体感染时，会导致口腔黏膜受损，引起炎症反应，从而引发一系列临床表现。

因为衣原体感染后会刺激机体产生免疫应答，释放炎症因子，这些因子会进一步激活白细胞，使其聚集于感染部位，进而引发炎症反应。此外，感染后的炎症反应还会导致血管通透性增加，使得血液中的白细胞和血浆蛋白渗出到感染部位，进一步加重了炎症反应。

如果患者除了口腔疼痛外，还伴有发热、头痛等症状，则可能是由细菌或病毒感染引起的口腔疾病。此时需要及时就医以确定具体病因，并接受相应治疗。

针对口腔感染衣原体感染的情况，建议患者在医生指导下使用抗生素治疗，同时避免接触已知有传染风险的人群，以防交叉感染。日常生活中还要注意个人卫生，定期清洁口腔，保持良好的生活习惯，有助于减少感染的风险。