晚上咳嗽不一定是衣原体感染，但可能与衣原体感染有关。

晚上咳嗽通常是因为睡眠时呼吸道受到刺激，如过敏、烟雾等。衣原体感染可引起呼吸道炎症，从而导致晚上咳嗽。但是晚上咳嗽也可能与其他因素，如哮喘、慢性支气管炎等疾病有关。因此，为了明确诊断，建议进行相关检查，如血常规、胸部X线检查或PCR检测。

晚上咳嗽还可能是由吸烟、空气污染、胃食管反流病等原因引起的。这些因素可能导致气道敏感性增加，夜间平卧位时易诱发咳嗽。

在诊断晚咳嗽是否为衣原体感染时，应排除其他潜在原因，避免误诊。同时注意保持室内空气清新，并戒烟限酒以减少夜间咳嗽的发生。