胆囊结石术后三个月仍疼痛需警惕术后并发症或其他潜在疾病。

术后三个月疼痛可能源于术后并发症，如出血、穿孔等；也可能是由于未完全移除的结石导致的慢性炎症或新发结石形成。建议进行详细检查以确定具体原因，并接受相应治疗。

如果患者在手术后仍然感到持续的腹部疼痛，还需要考虑是否存在消化道梗阻、肠粘连等问题。这些都需要进一步的影像学检查来明确诊断。

术后管理及随访对于监测恢复过程至关重要。患者应遵循医嘱调整饮食，避免油腻及易产生气体食物，以减少不适症状。