做完人流3天后肚子疼可能是正常的子宫恢复过程，也可能是宫腔残留或感染引起的。

正常子宫恢复过程中，由于子宫内膜受损和修复，可能会引起轻微的腹痛，通常会随着时间逐渐缓解。而宫腔残留或感染则会导致持续性的腹痛，并可能伴有其他症状如阴道出血量多、发热、下腹压痛等。如果疼痛程度加剧或伴有其他不适症状，建议及时就医进行检查以确定具体原因并接受相应治疗。

如果患者在术后短时间内剧烈运动或者过早同房，则可能导致身体受到刺激，出现腹部疼痛的症状。

总之，人流手术后腹痛是常见的现象，但如果疼痛程度加剧或伴有异常出血等情况时需警惕并发情况的发生。建议定期复查以及注意休息与个人卫生，若疼痛持续不缓解应及时复诊。