每天早晨直肠疼痛可以考虑采取中药调理、腹部按摩、饮食调整、肛门括约肌功能锻炼、直肠镜检查等治疗措施。如果疼痛持续或加剧，建议及时就医以排除其他潜在的消化系统疾病。

1.中药调理

通过服用具有清热解毒、利湿止痛功效的中药，如黄连、黄芩等，可以缓解直肠炎症引起的晨起时的不适感。对于存在肠道敏感性高的人群，可考虑使用非处方止泻药如复方苯乙哌啶片、蒙脱石散等来减轻腹泻症状。

2.腹部按摩

腹部按摩有助于促进消化道血液循环，缓解肌肉紧张，从而减轻直肠区域的不适感。对于因长期久坐导致肠道积气而引起腹胀者，适当增加腹部按摩次数，每次5-10分钟，每日3次左右即可。

3.饮食调整

改变饮食结构，减少辛辣刺激食物摄入，增加膳食纤维含量高的食物如燕麦、芹菜等，有利于改善肠道环境，减轻晨起时的不适感。适用于经常出现便秘或排便困难的人群。日常生活中要注意多吃蔬菜水果，多喝水，保持大便通畅。

4.肛门括约肌功能锻炼

肛门括约肌功能锻炼包括提肛运动等，旨在增强肛门括约肌的力量和协调性，对缓解晨起时的直肠不适有积极作用。此方法适合于任何人群，特别是需要长时间坐着工作的人士，每日坚持练习可以帮助改善局部血液循环，预防痔疮的发生。

5.直肠镜检查

直肠镜检查是一种侵入性诊断手段，医生能够直接观察到患者的直肠内部情况，并取样进行病理学分析，以确定是否存在病变。对于不明原因的下腹部疼痛、排便习惯改变等症状较为明显者，应考虑进行此项检查以排除结肠及直肠器质性疾病。

在处理直肠疼痛时，应避免食用可能加重肠道负担的食物，如高脂、油炸食品。同时建议患者注意休息，保证充足睡眠，避免熬夜，以免影响机体恢复。