自然流产胚胎没流掉时，需要进行刮宫手术来清除残留物。

自然流产过程中，部分胚胎组织可能会滞留于宫腔内，如果不及时处理，可能会引起持续出血、感染等并发症，因此建议通过刮宫术将残留物彻底清除。术后应遵循医嘱进行休息和恢复，并定期复查以确保身体恢复正常。

如果B超检查显示子宫内仍有胎囊存在，则可能是不完全性流产或稽留性流产。不完全性流产是指部分胎儿组织已经排出体外，但仍有部分留在子宫内；稽留性流产则指胎儿停止发育后未能及时排出，导致死胎滞留在子宫内。

在诊断为自然流产的情况下，应注意观察阴道出血量以及是否有腹痛等症状。若出现异常情况应及时就医，以便得到适当的治疗。同时，在此期间还要注意个人卫生，避免过度劳累和情绪波动。