月经推迟3天且伴有小腹痛、腰酸痛可能是排卵期或黄体功能不足引起的。

月经推迟3天属于正常范围内的生理现象，不需要过多担心。而小腹痛、腰酸痛则可能是由于排卵期时卵巢破裂导致的轻微出血和子宫收缩所致；若为黄体功能不足，则是由于黄体分泌的孕酮减少，使子宫内膜不能维持其正常的生长状态，从而引起撤退性出血及下腹坠胀感。

此外，如果患者在服用避孕药期间出现月经推迟3天小腹痛腰酸痛的症状，可能与药物副作用有关。

针对月经推迟3天小腹痛腰酸痛的情况，建议女性定期监测体温变化，并观察经期是否规律来临。若症状持续不缓解或者伴随其他不适，应及时就医检查以确定具体原因并接受相应治疗。