意外怀孕后发生自然流产可能是染色体异常所致。

染色体异常是指细胞内染色体的数量、结构发生变化，包括缺失、重复、易位、倒位等，这些异常可能会干扰正常的基因功能，影响胚胎的生长和发育，导致自然流产的发生。当精子或卵子中的染色体发生异常时，受精后的胚胎通常无法正常分化和发育，因此容易导致自然流产。

此外，如果孕妇在孕期感染了巨球蛋白血症、风疹病毒等病原体，或者接触了放射性物质、化学毒物等有害物质，也可能增加自然流产的风险。

若患者出现阴道出血、腹痛等症状，应及时就医以评估是否需要进一步的超声检查或其他辅助诊断措施。建议女性在计划外怀孕的情况下，定期进行产前检查，及时发现并处理潜在的问题。