北京协和医院、首都医科大学附属北京儿童医院、北京大学第一医院、中国人民解放军总医院、北京积水潭医院等北京的医院可以治疗小肠结肠炎耶尔森菌肠炎。由于小肠结肠炎耶尔森菌肠炎的治疗需要特殊药物和专业医疗设备，建议患者在就医前咨询医生并进行确诊。
1.北京协和医院
北京协和医院是国家卫生健康委员会指定的疑难重症诊治指导中心，其感染科在处理复杂病例方面具有丰富经验。感染科集临床、教学、科研于一体，在细菌性痢疾、霍乱等传染病诊断及治疗上积累了大量经验，且拥有先进的检测设备和技术力量。
2.首都医科大学附属北京儿童医院
首都儿科研究所附属儿童医院是中国儿科学会确定的全国儿科学临床研究基地之一，也是北京市儿科学住院医师规范化培训基地。该医院擅长于小儿内科疾病的诊疗，对于儿童的小肠结肠炎耶尔森菌肠炎也有较好的诊治能力。此外，该医院还设有感染性疾病科，可为患者提供全面的医疗服务。
3.北京大学第一医院
北京大学第一医院是一所三级甲等综合医院，其消化内科在小肠疾病的研究和诊治方面处于国内领先地位。该医院的消化内科在小肠结肠炎耶尔森菌肠炎的诊断和治疗方面经验丰富，能够为患者提供专业的医疗建议和治疗方案。
4.中国人民解放军总医院
中国人民解放军总医院是全军医学专科设置最齐全、技术力量雄厚的大型综合性医院，其感染病科在国内享有较高声誉。该医院的感染病科专注于各类感染性疾病的诊治，包括小肠结肠炎耶尔森菌肠炎，其团队具备丰富的临床经验和精湛的技术水平。
5.北京积水潭医院
北京积水潭医院是一家以骨科、矫形外科为重点学科的三级甲等公立医院，其感染科在处理创伤后感染等方面有独到之处。该医院的感染科针对小肠结肠炎耶尔森菌肠炎的治疗有独特的治疗方法，如使用抗生素进行治疗，同时还会给予营养支持治疗。
在选择医院时应考虑上述因素，并结合自身情况做出明智的选择。在治疗期间，患者应注意休息，避免过度劳累，保持良好的个人卫生习惯，以促进病情恢复。
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