本着“公平、公正、公开、公益”的宗旨，2011中国健康年度总评榜所有奖项提名评选都将由一套完整的评估体系来完成，包括硬性指标评估、网友意见、专家组意见、健康专业媒体意见结合的方式评定。硬性指标、网友评选、专家组意见分别占总分比值的25%、50%、25%。
硬性指标硬性指标是对提名机构、产品、品牌等的基本素质、硬软实力、品质、行业表现、业绩等多维的考核指标。硬性指标评估报告将采用资料分析，实地调查，消费者调查，专家组调查等方式完成。其中资料分析的数据库将来源于39健康网强大的医院、医药数据库以及合作研究机构的数据库。实地调查与消费者调查，将由中国健康年度总评榜评估小组开展，期间将会与相关医院管理机构及连锁百强药店进行合作，采集整理市场一线真实数据。专家组调查将会由39健康网专家库中抽取百名全国知名专家来对某些硬性指标进行公正的、不记名形式的打分。
以下是各榜单的硬性指标：
医疗榜| 项目 | 指标 | |||
|---|---|---|---|---|
| 硬件 | 医疗办公占地面积 | 床位数 | 科室数 | 重点学科 |
| 软件 | 医师数量 | 高级职称人员 | 硕博以上导师 | 全国知名专家 |
| 其他 | 门诊量 | |||
按病理大致可以分为感冒药、妇科药、抗过敏药、肠胃药、皮肤病用药、心脑血管药等药品品牌的的评选。
评选标准如下：
| 药品类别 | 如感冒药 | |||
|---|---|---|---|---|
| 药品名称 | ||||
| 考察对象 | 药品评选指标： 5—0分为满意程度，分值越高表示越满意或者倾向程度越高，低则相反。9为无效，表示不了解该项药物 | |||
| 上市时间 | ||||
| 违规违禁事件 | ||||
| 如果你是医生 | 临床安全性 | 患者反馈 | 治疗常选用药 | |
| 分值 | ||||
| 如果你是普通群众 | 药物疗效 | 牌知名度 | 价格 | 考虑用药 |
| 分值 | ||||
| 器械名 | 指标 | 数值 | 评估得分 |
|---|---|---|---|
| 操作性 | |||
| 安全性 | |||
| 性价比 | |||
| 品牌知名度 |
网友评选采用计票制。39健康网将在网站推出榜单评选专题，接受全国网友公正、公开评选。
专家组评选采用计分制，取专家组总分的平均分为被评单位的最后得分。专家组成员为国内著名的学者、主管部门领导、相关协会领导、专业研究机构人员、健康行业专业主流媒体的资深从业人员等。
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