“公立医院改革试点方案”本应在2009年底出台，但现在不得不推迟。究其原因，全国不同地区的公立医院复杂的权属关系以及随之而来的补偿机制不到位，是该方案不得不延期的主要原因。这引发网友对公立医院改革的议论。
公立医院补偿渠道不畅
新浪博主“宜昌人可”指出，近年来，公立医疗机构收入受到限制，而支出却要按政策和市场运作，业务收支亏损严重。这主要体现在收入增长受到限制、支出增长因素较多、依靠负债推动发展。但是，公立医院的补偿渠道却不畅通。“宜昌人可”说，医疗服务价格4年未作调整，这与其间居民消费价格及医用材料价格的不断上涨是不相协调的。另外，财政补助水平基本未变，特别是工资制度改革后并未增加相应的财政补助。
此外，还有网友认为，医改新政对公立医院改革效果尚有待观察。取消药品加成会使公立医院的运行更加困难，频繁调整医疗服务价格和大幅增加财政投入的可能性不大，取消药品加成并不一定能达到制度设计之初衷。
会否被逼走“市场化”道路
有网友担心，公立医院在补偿机制不到位的情况下，会被逼上市场化道路。
广东省卫生厅副厅长廖新波在博客中写道：一些地方政府医院的公益性将难以得到保证，甚至被迫走上市场化的道路。廖新波认为，如果公立医院改革是在缺乏财政的有力支撑、缺乏医保制度同步改革的情况下进行，公益性将难以保证。
马鞍山市医疗集团总院长何少峰也指出，北京、上海等大城市并不用担心没钱，地级市的医院根本拿不到充足的财政投入，怎么办，自己想办法。
改制重组是必由之路
在公立医院改革搁浅之时，许多网友认为，改制重组是必由之路。
新浪博主“医生哥波子”说，我们对公立医院的改革一直认为是产权不清的问题。
新浪网友写道：目前问题在于，公立医院的法人治理结构多不规范，所有权、决策权、经营权、监督权模糊不清，再加上政府的投入不足，由此导致多数公立医院的逐利倾向，将经济目标凌驾于社会目标之上，使公立医院难以姓“公”。
新浪博主“宜昌人可”也指出，改制重组是深化公立医院改革的必由之路，不触及产权制度的改革是肤浅的，是难于深度推进的，也是难于达到改革目的的。既然如此多的公立医院全部由政府来“主导”既无必要也不现实，那就只好痛下决心，坚定不移地保留一部分、改制一部分。接下来的问题是，要保留多少公立医院，以及保留哪些医院。保留的公立医院的数量、规模要适度，不能“卖光”、“改净”，这不仅涉及传统的办医体制问题，也涉及政府权力(责任)边界的界定问题。具体保留多少应根据城市规模大小确定，以体现政府责任、满足群众需求、有利于临床医学发展为原则。
此外，除保留的公立医院外，现有其他公立医院应进行改制重组，市场化运作。一是实行产权多元化，通过实施股份制改造，吸收非国有资本加入，形成混合所有制医院。二是产权重新安排，将一部分医院的资产所有权与经营权分离，实行国有民营;另一部分医院政府完全退出，改制为民办非营利性医院或民办营利性医院。
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