生殖疱疹病毒感染肠道可能导致轻度至重度的胃肠道不适，包括腹痛、恶心呕吐及腹泻等症状。

生殖疱疹主要是由单纯疱疹病毒感染引起的疾病，当病毒进入血液循环时，可能会对肠壁细胞造成直接损害，进而引发上述不适症状。若不及时治疗，这些症状可能进一步加重，甚至出现溃疡、出血等问题。

此外，如果患者免疫系统受损或存在共存性疾病，如HIV感染或糖尿病，则可能出现更为严重的并发症，如伪膜性结肠炎等。

在诊断生殖器疱疹感染时，应考虑进行全面的身体检查，包括直肠指诊和实验室检测，以排除其他潜在病因，并确保得到准确的诊断和适当的治疗。