支原体、衣原体感染后，致病菌产生的毒素以及炎症因子作用于中枢神经系统，会引起全身疲惫的现象发生。

上述两种致病菌在侵入人体后，会产生内毒素及外毒素等有害物质，并刺激机体产生大量的炎症因子，如白介素-1β、肿瘤坏死因子α等。这些炎症因子具有一定的神经毒性，能够直接作用于中枢神经系统，使患者感到疲乏无力；同时，炎症因子还会诱导巨噬细胞活化，进一步加剧炎症反应，从而引发全身性的症状。

此外，如果患者存在免疫功能低下或长期处于应激状态，也可能会导致感染后的恢复过程延长，进而加重全身疲惫的症状。

针对支原体、衣原体感染引起的全身疲惫，患者可在医生指导下使用阿奇霉素或多西环素进行治疗。患者平时应注意休息，避免过度劳累，保证充足的睡眠时间，以促进身体康复。