尿道下裂术后阴茎小可能是由于术中对阴茎组织的损伤、瘢痕形成导致的。

尿道下裂手术需要切开阴茎部分组织以便修复尿道位置，这会造成一定的组织损伤和瘢痕形成，进而影响阴茎的生长发育。因此，在术后可能出现阴茎短小的情况。

若患者还存在激素水平异常或染色体异常等疾病时，也可能出现尿道下裂术后阴茎小的现象。

在考虑尿道下裂术后阴茎大小的问题时，应注意术后恢复过程中的各项护理措施是否得当，以及是否存在其他可能影响阴茎发育的因素。