阴茎短小者医生会根据患者的实际情况采取药物、手术等治疗措施。阴茎短小，是指阴茎外观正常、但长度小于同龄人平均长度2.个标准差以上者。阴茎的长度与直径比值正常，部分病例可有阴茎海绵体发育异常，睾丸发育差或下降不全。目前，国内尚无权威标准定义，一般认为我国成年男性阴茎疲软和勃起状态的平均长度分别为8.1cm和10.6cm，阴茎周径分别为8.3cm和12.1cm。对于小儿，需要根据年龄与正常年龄段儿童进行比较，若足月新生儿阴茎牵拉长度≤1.9cm，可视为阴茎短小。
1、药物治疗
医生根据患者的实际原发病选择相应的治疗药物，如促性腺激素释放激素、绒毛膜促性腺激素、睾酮等。青春期之前给予2%双氢睾酮霜抹在下腹部及外阴部，可使阴茎增大，如至青春期之后，即使给予双氢睾酮制剂亦无效果。
2、手术治疗
对于使用激素进行内分泌调节治疗无效的患者，可咨询专业的医生，慎重选择进行手术治疗。可考虑行阴茎延长术、阴茎再造术、阴茎假体置入术。术后要加强护理，注意休息，减少运动量，适当的吃些优质蛋白的食物，保证营养均衡，避免辛辣刺激性食物，不要喝酒，保持心情舒畅，避免不良情绪，定期去医院复查。
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