但是食管位置特殊，临近肺部和心脏，传统的光子放疗会造成放射性肺炎、心包炎、心肌炎、心肌梗死等严重的放疗副反应。而质子治疗作为新兴的放疗技术，可以精准杀伤肿瘤细胞，减少放疗对周围正常器官及组织的伤害，已经成为食管癌患者放疗的。

三维适形放射治疗（3D-CRT）以及质子治疗食管癌的效果和产生的毒副作用进行了对比分析，研究结果显示，与IMRT、3D-CRT相比，质子治疗持续降低了心脏和肺的放疗剂量，减少了放射性肺炎、心脏积液等常见放疗毒副作用的发生概率。

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