任何药物均有正面积极的疗效和一定的不良反应。5型磷酸二醋酶抑制剂也不例外，它治疗勃起功能障碍具有显著疗效，但也有一些不良反应。其不良反应在不同的个体有不同表现。

总体上来说，发生率为小于10%而且人体可以耐受，没有必要特别去处理，大多数可以自行缓解，并且停药后可以完全消失。根据发生的部位，伟哥类药物的这些不良反应可粗略的分为以下4类。

1.血管作用

引起头痛(16%)、颜面潮红(10%)和鼻炎(4%)(后者可能是PDE5引起鼻黏膜充血 )。眩晕(2%)、低血压(<2%)和体位性低血压(<2%)罕有报告，并且在西地那非和安慰剂治疗组发生率相似。

2.胃肠道作用

引起消化不良和由于低位食管括约肌松弛引起的反流性烧灼感。

3.视觉异常

除他达拉非外，西地那非、伐地那非对PDE6有选择性抑制作用，可致视觉异常，引起蓝视、眩光和视觉模糊(3%)，特别是在较大剂量时。前述不良反应通常是轻微，短暂的。

4.肌肉骨骼作用

引起肌无力，特别是在每日多次服用时。但未见与治疗相关的血浆肌酸磷酸激酶或肌电图变化。对这一作用尚无明确的药理学解释。

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