小儿尿道下裂并不一定是先天性的，其病因较复杂，可能与尿道形成的相关基因异常、内分泌紊乱、遗传因素等有关，主要包括常染色体异常、雌激素异常、尿道海绵体异常、尿道口狭窄等原因导致的，还可能是后天性因素造成的，因为小儿不会说话表达不清，只能通过症状表现进行判断。

一、先天性因素：

1、常染色体异常：伴随基因遗传，胚胎期母体受到药物、放射线等不良因素影响，导致基因突变，可导致尿道沟部融合缺陷，引起尿道下裂，一般出生后会出现症状;

2、雌激素异常：孕期母体患有自身免疫性疾病，或者胎盘发育异常等，导致雌激素水平较低，影响尿道正常发育，可导致小儿尿道下裂;

3、尿道海绵体异常：胚胎期原始尿道海绵体发育不全，或者后天尿道海绵体发育不全，可导致小儿尿道下裂;

4、尿道口狭窄：如果胎儿期尿道口发育异常，未经阴道娩出，在出生时即可出现尿道口狭窄，导致小儿尿道下裂。

二、后天性因素：

1、常染色体异常：胚胎期母体受到细菌、病毒、药物、放射线等不良因素影响，或者胎儿在宫内受到感染等因素影响，可导致尿道下裂;

2、雌激素异常：孕期母体患有自身免疫性疾病，或者胎盘发育异常等，导致雌激素水平较低，影响尿道正常发育，可导致小儿尿道下裂;

3、尿道海绵体异常：胚胎期尿道海绵体发育不全，或者后天尿道海绵体发育不全，可导致小儿尿道下裂;

4、其他原因：尿道异物、尿道闭锁、内分泌紊乱等因素，均可导致小儿尿道下裂，需进行鉴别。

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