干扰素治疗HPV具有较好的效果，干扰素具有抗病毒、抗增殖和免疫刺激的作用。
干扰素的适应症为治疗具有尖锐湿疣、带状疱疹、问诊卫星 jrsy58生殖器感染疱疹等HPV病毒感染的疾病及由HPV引起的某些恶性肿瘤。
根据临床试验，干扰素已显示通过皮内注射治疗尖锐湿疣有效，但没有证据支持全身干扰素用于治疗尖锐湿疣，妊娠期禁用。
副作用主要为低热和流感样症状，常为一过性，一般可以对症进行处理，之后问题即可得到缓解，随着近年来干扰素制剂的改进，这些不良反应在减少。
局部和皮损内药物注射干扰素治疗是近年来被逐渐应用于临床的，用于难治性尖锐湿疣等HPV感染的治疗方法，除干扰素局部注射外，还会用到念珠菌、卡介苗、纯化生物蛋白衍生物、HPV-6VLPs等，需在专业医师指导下应用。
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