菜花状疣体在治疗上需要根据皮疹大小决定具体的治疗方案，如果是呈粟粒至蚕豆大小的疣体可以选择外涂药膏进行治疗，可以涂抹重组人干扰素α-2b软膏1天4次，或者咪喹莫特软膏1天2次进行治疗，也可以配合应用维A酸软膏1天1次涂抹治疗。如果是疣体数目比较多可以应用中药擦洗或者泡洗的方式，
主要的组成成分是马齿苋、生薏苡仁、黄柏、红花、赤芍、珍珠母、问诊卫星 jrsy58磁石煎水泡洗1天2次。也可以应用冷冻、电离子灼烧术或者激光灼烧术的方式进行治疗，针对直径比较大的疣体，通常大于2cm以上可以选用上述方案。
菜花状的疣体疾病，临床上考虑是尖锐湿疣。发生了菜花状的尖锐湿疣以后，主要的治疗方式有以下几点，1.可以外用咪喹莫特乳膏，抗病毒治疗。2.可以利用某些激光疗法，例如激光烧灼术或者是光动力来治疗疣体。3.可以使用外科手术来去除巨大的疣体。4.可以口服某些调节免疫的药物，例如口服胸腺五肽或者胸腺肠溶肽来提高机体的免疫力，防止疣体复发。
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