肛门处长了尖锐湿疣，初期症状往往较为隐匿，容易被忽视。多数患者首先会在肛周皮肤或黏膜表面发现细小的淡红色丘疹，这些丘疹质地柔软，顶端稍尖锐，可能单独出现，也可能因病毒持续复制而逐渐增多、聚集，形成簇状或片状分布。由于初期疣体体积较小，且无明显疼痛或瘙痒感，患者常误以为是痔疮、肛周湿疹或皮肤过敏，从而延误就医时机。
随着病情进展，疣体会逐渐增大，形态也更为典型。典型的尖锐湿疣表现为菜花状、乳头状或鸡冠状增生物，表面粗糙不平，颜色可能从淡红色渐变为灰白色或污灰色，部分疣体因局部摩擦或分泌物刺激，表面会出现渗液、糜烂甚至出血，形成血痂或污垢附着，伴随明显异味。此时，患者可能因肛周异物感、潮湿感或排便时摩擦疼痛而察觉异常，尤其在久坐、运动或清洁肛周时，不适感会进一步加重。
尖锐湿疣的另一典型症状是局部瘙痒，这种瘙痒常呈阵发性发作，夜间或温暖环境下可能加剧。由于肛周皮肤娇嫩，患者可能因反复搔抓导致皮肤破损，进而引发细菌感染，出现红肿、疼痛甚至化脓。若疣体生长于肛管内，患者还可能感到排便不尽感或肛门坠胀感，部分严重病例因疣体阻塞肛管，导致排便困难或粪便变细，需与痔疮、直肠息肉等疾病鉴别。
值得注意的是，部分患者可能无明显自觉症状，仅在体检或偶然触摸时发现肛周异常。此外，尖锐湿疣的潜伏期通常为1-8个月，平均3个月，这意味着从感染HPV到出现疣体可能存在较长时间间隔，期间患者可能无任何不适，但病毒仍在持续复制并具有传染性。因此，若近期有不安全性行为、肛交史或接触过尖锐湿疣患者，即使肛周暂无症状，也应定期进行肛周检查，以便早期发现、早期干预。
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