肛门病毒疣通常是指肛门尖锐湿疣，由人乳头瘤病毒感染引起，主要通过性接触传播。肛门尖锐湿疣可以应用抗病毒药膏，如阿昔洛韦乳膏、咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏、赛儿茶素软膏等。
1、阿昔洛韦乳膏：是嘌呤核苷类似物，主要通过细胞病毒特异性核糖核酸起到抗病毒作用。阿昔洛韦乳膏可用于单纯疱疹病毒或带状疱疹病毒的治疗，而肛门尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起，因此可在医生指导下外用阿昔洛韦乳膏进行治疗;
2、咪喹莫特乳膏：是一种免疫调节药，咪喹莫特乳膏主要通过调节人体的免疫机制，而发挥治疗作用。肛门尖锐湿疣属于性传播疾病，主要是通过性接触传播，在使用咪喹莫特乳膏前，应先清洁生殖器和肛周，将药膏涂抹在疣体处，药膏可在24小时内完全吸收;
3、鬼臼毒素软膏：是一种治疗皮肤尖锐湿疣的药物，鬼臼毒素软膏能够通过抑制人乳头瘤病毒的复制，从而使疣体脱落，达到治疗肛门尖锐湿疣的目的;
4、赛儿茶素软膏：为非甾体类的抗炎、抗增生药，赛儿茶素软膏具有抗增殖的作用，可通过调节细胞免疫，从而起到治疗肛门尖锐湿疣的效果。
除上述药膏外，还有重组人干扰素α2b凝胶、鬼臼毒素酊、氟尿嘧啶软膏等药膏，均可以用于肛门尖锐湿疣的治疗。如果肛门尖锐湿疣的疣体较大，在使用外用药膏的同时，还可以进行液氮冷冻或者激光治疗，以消除疣体。
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