阴超探头感染衣原体是因为使用了未经消毒的探头，导致与感染者体内的病原体发生了交叉感染。

在进行阴超检查时，如果探头没有经过严格的消毒处理，或者医护人员操作不当，都可能使探头上携带的病原体传播给接受检查者。衣原体是一种细胞内寄生的微生物，主要通过性接触传播，也可经由非性途径如母婴传播、医源性传播等方式传播。当患者接触到受污染的探头时，其可趁机侵入人体细胞内部，并利用自身的特殊代谢方式，在宿主细胞内繁殖和扩散，进而引发感染。

此外，若个人免疫力低下或存在皮肤黏膜损伤，也可能会增加感染的风险。

为了避免阴超探头感染衣原体，建议在进行任何医疗操作前确认医院是否采取了规范的消毒措施，并确保所使用的医疗器械是安全无菌的。同时，应保持良好的个人卫生习惯，避免不必要的性行为，以减少感染风险。