自然流产5天还未干净可能是蜕膜组织排泄不全、凝血功能障碍等原因引起的，建议患者到医院就诊检查。

上述情况下，如果胎盘绒毛剥离后蜕膜及血液积存在宫腔内不能顺利排出，可能会导致阴道流血时间延长，此时需要通过B超检查明确诊断。凝血功能异常会导致子宫收缩乏力，从而出现阴道流血不止的现象，因此可以进行凝血功能检测来确定是否存在凝血功能障碍。

若患者在自然流产后出现了感染的情况，也会引起阴道出血持续的时间较长。因为感染会刺激子宫内膜，导致其炎症反应加剧，进而影响子宫收缩和止血过程。

需要注意的是，在自然流产后的一段时间内，身体仍处于恢复期，应避免过度劳累和剧烈运动，以免影响子宫修复。同时还要注意个人卫生，保持外阴清洁干燥，避免感染的发生。