肾结石排出时尿道疼是因为结石移动引起的尿道狭窄和压力增加导致的。

肾结石在排出过程中，由于其形状不规则且表面粗糙，容易卡在尿道中造成机械性梗阻。这种梗阻会导致尿道内压力升高，进一步加重了疼痛症状。此外，肾结石排出时还可能伴随有尿频、尿急、尿色深黄等症状，这些都与泌尿系统受到刺激有关。因此，出现上述症状时，应及时就医以明确诊断并接受相应治疗。

如果患者存在感染性结石或合并尿路感染，结石排出时炎症因子会刺激尿道黏膜，也会引起尿道疼痛的症状。

对于肾结石患者，日常应注意多喝水促进排石，并避免摄入高钙食物，以免影响结石的顺利排出。若发现结石持续增大或伴有血尿等情况，则需及时就医调整治疗方案。