生殖衣原体不会直接导致眼睛感染，但可通过间接途径引起结膜炎。

生殖衣原体主要通过性接触传播，在繁殖过程中产生一种酶，称为溶菌酶，该酶具有一定的溶解细菌细胞壁的作用。当这种酶进入眼睛时，可能会破坏结膜上皮细胞，引发炎症反应，从而出现结膜炎的症状。因此，虽然生殖衣原体本身不直接感染眼睛，但其产生的溶菌酶可能导致结膜炎的发生。若出现相关症状，应及时就医进行诊断和治疗。

如果患者存在免疫缺陷或长期使用免疫抑制剂，可能会影响机体免疫力对抗衣原体感染，此时需要提高警惕。

在日常生活中，应采取安全性行为以减少生殖衣原体感染的风险。同时注意个人卫生，避免与他人共用毛巾、洗脸盆等物品，以降低交叉感染的可能性。