衣原体感染反复咳痰是因为衣原体在体内持续存在并产生炎症，炎症因子刺激呼吸道上皮细胞增生和分泌，引起反复咳痰的现象。

衣原体感染后，其抗原成分可作为过敏原，刺激机体产生免疫应答，产生IgE等炎性介质，这些炎性介质与肥大细胞和嗜酸性粒细胞表面的IgE受体结合，使这些细胞处于致敏状态。当再次接触相同抗原时，会发生交叉反应，导致这些细胞释放出大量的炎性介质，如组胺、白三烯等，这些物质会引起支气管平滑肌收缩，从而引发咳嗽和咳痰症状。

如果患者除了咳痰外还伴有发热、乏力等症状，则可能是由于感染引起的免疫反应导致的。这种情况下，需要及时就医，遵医嘱使用抗生素治疗，如阿奇霉素或多西环素等。

针对衣原体感染反复咳痰的情况，在日常生活中，应注意保持室内空气流通，避免接触已知过敏原，并注意休息，以促进身体恢复。