肠胃不会感染衣原体。

因为衣原体主要通过性接触、血液传播、母婴垂直传播等方式进行传播，而这些途径并不涉及消化道，因此肠胃一般不会被衣原体所感染。当出现消化道不适症状时，应及时就医以确定病因，并接受相应治疗。

如果患者存在长期免疫抑制或患有慢性疾病，其免疫力可能较低，此时易感性增加，但并非所有情况下都会导致感染。

在预防胃肠道感染方面，建议保持良好的个人卫生习惯，避免食用未经充分煮熟的食物，以及减少与有潜在健康风险的人群密切接触。若怀疑自身感染了衣原体或其他病原体，应立即就医以便获得适当的诊断和治疗。