先天性无精症患者意外怀孕是因为精子与卵子在输卵管内结合形成了受精卵，而没有经过常规的生殖系统检查。

先天性无精症是由于染色体异常、基因突变等原因引起的不育症状，此时患者的睾丸仍然能够产生精子，只是输精管发育不良或者缺失，所以会出现上述情况。

如果女性存在子宫畸形或宫颈功能障碍等不孕因素时，也可能出现这种情况。因为这些因素可能会影响精子进入宫腔，但并不影响卵子与已经存在的精子相遇形成受精卵。

对于先天性无精症患者而言，尽管意外怀孕了，但仍需关注妊娠期间可能出现的风险，并建议定期进行产前检查以监测胎儿健康状况。