闭经两年又有褐色分泌物可能是功能性子宫出血、子宫肌瘤等引起的，需要及时处理。

闭经两年通常是体内激素失衡造成的，此时雌孕激素撤退不全，会导致子宫内膜脱落异常，引起阴道流血，出现褐色分泌物的现象。如果还伴随腹痛等症状，则可能是子宫肌瘤引起的，当肌瘤体积增大时会压迫到周围组织，进而引发上述不适症状。

若患者既往有卵巢早衰或垂体功能减退症病史，也可能会导致闭经现象发生，但并不一定会直接导致褐色分泌物的产生。这种情况通常与生殖系统功能衰退有关。

针对闭经伴有褐色分泌物的症状，应尽快就医以确定病因，并接受相应治疗。同时，建议女性在日常生活中注意休息，避免过度劳累，保持心情愉悦，以免加重闭经症状。