衣原体感染后持续低热是因为病原体刺激机体免疫系统产生炎症反应，导致体温调节中枢紊乱。

衣原体是一种细胞内寄生的微生物，具有独特的发育周期，包括一个侵袭性阶段和一个非侵袭性阶段。当衣原体进入人体时，其抗原成分会刺激机体的免疫系统产生免疫应答，引发炎症反应。这种炎症反应可能导致体温升高，但不会引起高烧，而是以持续低热的形式存在。此外，衣原体感染还会引起全身症状，如头痛、肌肉酸痛等，这些症状也可能导致不适感和发热的感觉。因此，衣原体感染后出现持续低热可能是由病原体刺激机体免疫系统产生的炎症反应所致。

患者还可能出现乏力、食欲减退等症状，需考虑是否为慢性感染或继发耐药菌株引起的并发症。

针对衣原体感染的治疗通常采用抗生素治疗，如阿奇霉素或多西环素。在治疗期间，患者应注意遵循医嘱完成整个疗程，避免中途停药以防耐药性的产生。同时，保持充足的休息，均衡饮食，有助于促进病情恢复。