切除输卵管后伤口总是疼可能是术后并发症或继发性疾病所致。

术后并发症如感染可能导致伤口长期不愈合，进而引发持续性的疼痛。此外，输卵管疾病本身也可能引起下腹部不适，虽然输卵管已被移除，但原发疾病的症状仍可能存在。

如果患者在手术过程中出现血管损伤，可能会导致血肿形成，压迫周围组织，从而引起疼痛。另外，还可能与术后感染、粘连等有关。

因此，在切除输卵管后，患者应注意观察伤口是否红肿、渗出等症状，以及时发现异常情况并处理。