自然流产不一定会发生在晚上。

自然流产的发生通常与胚胎发育异常、激素水平变化等有关，而与时间无关。部分情况下，夜间时身体处于休息状态，此时不适症状会更加明显，误以为是在晚上发生流产。但并非所有情况下都是如此，因此不能单纯通过时间来判断是否会发生流产。若出现阴道出血等症状，建议及时前往医院就诊，以便进行适当的治疗。

如果孕妇在怀孕期间存在黄体功能不足或子宫肌瘤等问题，也可能会导致自然流产的发生，此时并不会受时间影响。

需要注意的是，在孕期要定期进行产前检查，保持良好的生活习惯，避免过度劳累和精神紧张，以减少自然流产的风险。