自然流产后月经褐色可能是由残留物组织引起的。

由于流产不完全，导致部分胚胎组织滞留于体内，持续刺激子宫内膜，进而引发上述现象。建议进行超声波检查以确定残留物的数量和位置，并在医生指导下通过刮宫术移除残留组织。

如果女性存在宫颈炎、子宫内膜炎等疾病时，在炎症因子的作用下可能会导致阴道出血量少且颜色呈褐色的现象。此时需要针对病因进行治疗，如宫颈炎可遵医嘱使用阿奇霉素或多西环素；子宫内膜炎则需遵循医师意见服用克林霉素或甲硝唑。

流产后应关注身体恢复情况，注意休息，避免过度劳累，保持外阴清洁干燥，避免感染风险。若出现异常症状应及时就医处理。