肛瘘手术后短期内轻度肛门疼痛通常是正常的。

术后短时间内，局部创伤尚未完全恢复，加上麻醉药物的作用减弱，此时可能会有轻微不适感。随着伤口逐渐愈合，这种疼痛会逐渐减轻至消失。如果疼痛程度加剧或伴随其他症状如发热、排便困难等，则可能是感染或其他并发情况的表现，需要及时处理。

肛瘘手术后患者可能出现感染、血肿形成、切口裂开等情况时，也可能会出现肛门疼痛的现象。

在肛瘘手术后，患者应密切观察肛门疼痛的变化情况，并注意保持肛周清洁卫生，避免剧烈运动，以促进伤口愈合和减少不适。