男性衣原体感染复发可能是由于衣原体在体内持续存在并反复刺激免疫系统，导致病情反复发作。

衣原体感染是一种细菌感染，具有一定的潜伏期，在初次感染后，虽然症状得到缓解甚至消失，但并不代表体内的病原体已经被完全清除。如果患者没有完成整个治疗周期或者在治疗过程中出现中断，可能会导致衣原体处于休眠状态，当机体免疫力下降时，这些休眠状态下的衣原体就会重新活跃起来，引发感染复发。此外，若患者在治愈后仍保持不良的生活习惯，如频繁更换性伴侣或不使用安全措施进行性行为，则会增加再次感染的风险。

衣原体感染的治疗通常包括抗生素治疗，例如阿奇霉素或多西环素等。患者应遵医嘱完成整个疗程，并定期复查以确保感染已被彻底清除。

预防衣原体感染复发的关键是采取正确的防护措施，包括使用避孕套、减少不必要的性伴侣以及定期进行性健康检查。同时，提高自身免疫力也是预防感染复发的重要手段，可通过均衡饮食、适量运动和充足休息来实现。