肛瘘患者进行灌肠一般不会感到疼痛。

因为灌肠能够润滑肠道，软化大便，使干结的大便易于排出，进而减轻因大便干燥而加重的局部刺激症状，所以并不会引起明显的疼痛感。但是，如果肛瘘出现急性发作或者存在复杂的情况，则可能会伴随有不同程度的疼痛，此时需要及时就医处理。

肛瘘患者在灌肠时若出现疼痛，可能与肛瘘本身引起的炎症、感染有关，也可能是灌肠过程中操作不当导致的损伤。此外，还应注意是否存在括约肌痉挛等情况。

在治疗肛瘘的同时，应关注个人卫生，保持肛门周围清洁干燥，并避免食用辛辣刺激性食物，以减少不适症状的发生。