急性咽喉炎咳嗽不止后发烧，需要及时就医以获得适当的诊断和治疗。

急性咽喉炎通常由病原体感染引起，此时免疫系统会启动防御机制对抗感染，但同时也产生大量炎症细胞和化学物质来清除病原体和坏死组织，这些炎症介质会导致体温调定点上移，引起发热症状。此外，咳嗽是机体的一种保护性反射，通过咳嗽可以将呼吸道内的异物或痰液排出体外，减轻炎症对呼吸道的刺激，而咳嗽的同时可能会加重炎症反应，进一步引起发热。

如果患者在出现急性咽喉炎的同时还伴随有吞咽困难、声音嘶哑等情况，则可能是细菌感染引起的化脓性扁桃体炎或者急性会厌炎等疾病。这些疾病的病因主要是由于致病菌侵袭所致，例如链球菌、葡萄球菌等，当致病菌进入体内时，会引起身体的免疫应答，从而导致发热的现象发生。

针对急性咽喉炎引发的咳嗽和发热，患者可在医生指导下使用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗。同时注意休息，避免辛辣食物，多饮温水，保持室内空气湿润。