新生婴儿沙眼衣原体感染是因为沙眼衣原体通过直接或间接接触传播给新生儿，导致结膜炎。

新生婴儿沙眼衣原体感染主要是由沙眼衣原体在结膜上皮细胞内繁殖所引起的传染性结膜炎。该疾病具有较强的传染性，可通过直接或间接接触传播，如母婴垂直传播、使用污染的眼药水或者毛巾等。

此外，若新生儿免疫系统发育不完善，也可能会增加感染的风险。

由于沙眼衣原体感染可能导致严重的并发症，因此家长应注意定期带孩子到医院进行眼科检查，并采取适当的预防措施以降低感染风险。